Sebaliknya, Dr. Mahathir Mohamad selaku Menteri Dalam Negeri terpaksa tampil ke hadapan bagi menyelamatkan maruah anak buahnya itu. 

Difahamkan, Dr. Mahathir kecewa dengan sikap Rahim Noor kerana gagal melaksanakan tugas dan arahan yang diperintahkan dengan baik. 

Malah, berdasarkan pita rakaman perbualan telefon antara Rahim dan Dr. Mahathir, jelas Dr. Mahathir memarahi Rahim kerana memukul Anwar sehingga meninggalkan kesan yang pada akhirnya memberikan simpati dan sokongan yang lebih besar kepada Dato' Seri Anwar. 

Dr. Mahathir kecewa kerana arahan beliau agar Anwar mengaku dan hilang pertimbangan tidak disempurnakan dengan baik oleh Rahim Noor.